Οι αρµοδιότητες του Εθνικού Κέντρου Ελέγχου καλύπτουν όλη την Ελληνική επικράτεια και είναι:
1. Η εισήγηση για τη χάραξη και υλοποίηση της Εθνικής Στρατηγικής, για τον έλεγχο και την εξάλειψη των νοσηµάτων.
2. Η εισήγηση για την συγκρότηση της Εθνικής Οµάδας Ειδικών, µε Απόφαση του Υπουργού Αγροτικής Ανάπτυξης και Τροφίµων.
3. Ο σχεδιασµός των αναγκαίων µέτρων για την καταπολέµηση των ασθενειών.
4. Η διεύθυνση, η παρακολούθηση και o συντονισµός της λειτουργίας των Τοπικών Κέντρων Ελέγχου µε σκοπό την έγκαιρη και αποτελεσµατική εφαρµογή των ανωτέρω µέτρων.
5. Η λειτουργία του ως συνδέσµου και η παροχή πληροφοριών στην Ευρ. Επιτροπή, στον Παγκόσµιο Οργανισµό για την Υγεία των Ζώων (ΟΙΕ), και την Ευρωπαϊκή Επιτροπή για την Ασφάλεια των Τροφίµων (EFSA).
6. Η λειτουργία του ως συνδέσµου µε τα διαγνωστικά Εργαστήρια.
7. Η λειτουργία του ως συνδέσµου και παροχή πληροφοριών στα άλλα Κράτη-Μέλη της Ευρωπαϊκής Ένωσης.
8. Η λειτουργία του ως συνδέσµου µε αγροτικούς –εµπορικούς τοµείς και τα Μ.Μ.Ε.(σε εθνικό επίπεδο).
9. Η λειτουργία του ως συνδέσµου µε τις αρµόδιες περιβαλλοντικές αρχές και φορείς για τον συντονισµό των ενεργειών για την κτηνιατρική και περιβαλλοντική ασφάλεια.
10. Η λειτουργία του ως συνδέσµου µε τα όργανα εφαρµογής του νόµου για την εξασφάλιση της ορθής εφαρµογής των ειδικών νοµικών µέτρων.
11. Η εισήγηση διευθέτησης οικονοµικών προβλέψεων για το σχέδιο έκτακτης ανάγκης, καθώς και για την κάλυψη των δαπανών που σχετίζονται µε την εµφάνιση των επιζωοτιών.
12. Η µέριµνα για την εξασφάλιση προσωπικού και άλλων πόρων στα Τοπικά Κέντρα Ελέγχου.
13. Η υποβολή στην Ευρωπαϊκή Επιτροπή σχεδίου προγράµµατος εµβολιασµού έκτακτης ανάγκης.
14. Η µέριµνα για την προµήθεια και διανοµή των εµβολίων και η οριοθέτηση των ζωνών εµβολιασµού.
15. Η διατήρηση της ενηµέρωσης και ετοιµότητας.
16. Η διευθέτηση εκπαιδευτικών προγραµµάτων και ο διορισµός προσωπικού για τα Κοινοτικά εκπαιδευτικά προγράµµατα.
17. Η λειτουργία του ως συνδέσµου µε γειτονικές ή τρίτες χώρες.
18. Η µέριµνα για την εφαρµογή οποιουδήποτε επιπλέον µέτρου κρίνεται απαραίτητο για την αποτελεσµατική αντιµετώπιση των νοσηµάτων.
Με τη σχετική υπουργική απόφαση ορίζεται ως ∆ιευθυντής του Εθνικού Κέντρου, η προϊσταµένη της ∆ιεύθυνσης Υγείας των Ζώων ∆ηλέ Χρυσούλα. Συντονιστής του Εθνικού ορίζεται η προϊσταµένη του Τµήµατος Λοιµωδών και Παρασιτικών Νοσηµάτων κτηνίατρος Κορού Λασκαρίνα-Μαρία και ο Προϊστάµενος του Τµήµατος Παθολογίας Πτηνών, Ζωικών Υδρόβιων Οργανισµών, Μελισσών και λοιπών ζώων, κτηνίατρος Περδικάρης Σωκράτης ανάλογα µε το νόσηµα.
Αναλυτικά η Στελέχωση του Εθνικού Κέντρου Ελέγχου και ολόκληρη η Υπουργική Απόφαση εδώ.