Η εφαρμογή του Προγράμματος ανατίθεται στους παρακάτω φορείς:
Σύμφωνα µε τις τεχνικές προδιαγραφές του Προγράμματος, θα πρέπει να λαμβάνονται αιμοδείγματα (τουλάχιστον 2-3 ml) από τα πουλερικά των επιλεγμένων πτηνοτροφείων είτε κατά τη διάρκεια είτε μετά το πέρας της εκτροφής τους, στο σφαγείο. Εφόσον τα σφαγεία εδρεύουν εκτός του νομού προέλευσης των πουλερικών, αυτά θα δειγματίζονται από τις αρμόδιες για τα σφαγεία ∆/νσεις Αγροτικής Οικονομίας και Κτηνιατρικής, κατόπιν ενημέρωσής τους από τις αρμόδιες για τα πτηνοτροφεία αντίστοιχες ∆/νσεις.
Τα πτηνοτροφεία θα δειγματίζονται µόνο µία φορά το έτος στο πλαίσιο του παρόντος Προγράμματος ενώ, όπου είναι αυτό δυνατό, κρίνεται σκόπιμο οι δειγματοληψίες αυτές να συνδυάζονται µε αντίστοιχες δράσεις άλλων προγραμμάτων (πχ πρόγραμμα ελέγχου σαλμονελώσεων). Προκειμένου να επιλέγονται προς δειγματισμό τα πτηνοτροφεία υψηλού κινδύνου, θα λαμβάνονται υπόψη τα παρακάτω κριτήρια:
α) Η εγγύτητα σε υδροβιότοπους, ποτάμια, λίμνες, δέλτα ποταμών, λιμνοθάλασσες και γενικότερα σε περιοχές όπου παρατηρείται μεγάλη συγκέντρωση άγριων μεταναστευτικών πτηνών.
β) Η πυκνότητα των πτηνοτροφείων στην ευρύτερη περιοχή.
γ) Το επίπεδο των εφαρμοζόμενων μέτρων βιοασφάλειας.
δ) Η ταυτόχρονη παρουσία διαφορετικών ειδών πουλερικών και ιδιαίτερα νησσών και χηνών.
ε) Η συχνότητα, το εύρος και το είδος των μετακινήσεων, προς και από τα πτηνοτροφεία, πουλερικών και προϊόντων τους, ζωοτροφών, εξοπλισμού, προσωπικού και οχημάτων.
Αναλυτικά το Πρόγραμμα Επιζωοτιολογικής Διερεύνησης της Γρίπης των Πτηνών.